В собрании книг, накопленных в Сахалинской областной универсальной научной библиотеке за более чем полувековой период деятельности, особое место занимает фонд особо ценных и редких документов. Раритетный фонд выделен из состава основного фондохранения в 1956 году. Он состоит из уникальных и особо ценных печатных историко-культурных памятников и документов в количестве более 25 000 ед. хр. и представляет историческую, художественную ценность и социальную значимость для Сахалинской области. Фонд на протяжении всей истории библиотеки формировался в процессе приобретения, чаще всего путём получения в дар от пользователей. Первые издания, составившие основу редкого фонда библиотеки, поступили в период с 1948-го по 1956 год. Государственная библиотека СССР имени В. И. Ленина (ныне Российская государственная библиотека) передала в дар островной библиотеке уникальные памятники книжной культуры, в том числе в обмен на трофейную японскую литературу. Основными источниками комплектования того времени также стали Государственная публичная библиотека имени М. Е. Салтыкова-Щедрина (ныне Российская национальная библиотека), Ленинградский книготорг, а также Государственный фонд литературы, который был создан в 1943 году и предназначался для восстановления разрушенных войной библиотек и их фондов. 

В хронологические границы фонда особо ценных и редких документов включаются все имеющиеся в библиотеке издания, вышедшие в свет до 1950 года. Книги, выпущенные после 1950 года, распределялись в соответствии с определенными критериями отбора.

Часть фонда представлена личными, тематическими, видовыми коллекциями. За годы истории развития библиотеки и специализированного фонда сформировано 16 коллекций, которые являются особой ценностью редкого собрания.

Основу фонда составляют печатные издания, выпущенные в XVI  ̶  начале XX века:

• первые и прижизненные издания произведений выдающихся учёных, писателей и общественных деятелей, в том числе Л. Н. Андреева, Д. Н. Анучина, И. А. Бунина, П. П. Гнедича, А. И. Гончарова, В. Г. Короленко, А. И. Куприна, Я. И. Перельмана, Я. П. Полонского, Е. Тарле, Л. Н. Толстого, А. П. Чехова, М. Твена и других;
• издания, иллюстрированные и/или оформленные выдающимися художниками, в том числе А. Н. Бенуа, И. Я. Билибиным, М. А. Врубелем, М. В. Добужинским и другими;
• замечательные образцы полиграфического исполнения и переплётного мастерства, в том числе книги, изданные М. О. Вольфом, А. Ф. Марксом, А. Ф. Смирдиным, вышедшие в издательствах Р. Р. Голике и А. И. Вильборг, М. В. и С. В. Сабашниковых, И. Н. Кнебеля, «Academia» и других;
• книги с автографами и владельческими надписями известных деятелей науки и культуры страны: А. И. Медведева, Б. С. Мейлаха, Ю. Друниной, М. Дудина, Р. Казаковой, Л. Ошанина, М. Пляцковского, Ч. Айтматова, П. Алешковского и других известных персон, которые в разные периоды времени посещали остров.

Необходимо добавить, что фонд особо ценных и редких документов распределён в нескольких структурных подразделениях Библиотеки: депозитарный фонд – в Отделе краеведения, фонд ценных и редких изданий на иностранных языках расположен в Информационном центре международного сотрудничества, фонд библиографических изданий – в Центре информационной и цифровой культуры и в Отделе формирования, управления фондами и каталогизации – печатные издания, собранные по хронологическим и социально значимым критериям.  В отношении всех этих данных документов устанавливается особый режим учёта, хранения и использования.

Сведения об изданиях из фонда особо ценных и редких документов можно найти в электронном каталоге OPAC-Global (база данных "Редкий фонд"), традиционных карточных каталогах, а также в библиографических пособиях.

Документы из фонда особо ценных и редких документов предоставляются, экспонируются и копируются в соответствии с Правилами пользования библиотекой и Правилами пользования документов из фонда особо ценных и редких документов СахОУНБ.